RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 CRISP1P54107 249 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PRSS53Q2L4Q9 553 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 FRMPD2BQ6IN97 320 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 OR9A1PQ8NGU1 263 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CORO1BQ9BR76 489 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 RNF167Q9H6Y7 350 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM39Q9HCM9 518 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CLN6Q9NWW5 311 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 ZW10O43264 779 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 TGFB1P01137 390 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 GBAP04062 536 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 ELFN1P0C7U0 828 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 UQCRC2P22695 453 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 XPAP23025 273 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 SOX6P35712 828 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CCR2P41597 374 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 TPTEP56180 551 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PLAG1Q6DJT9 500 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC190Q86UF4 302 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 HTRA1Q92743 480 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 UBE2E3Q969T4 207 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PDXPQ96GD0 296 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 Q96MT0 163 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 MGLLQ99685 303 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 QPCTLQ9NXS2 382 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 A0A075B6Q4 140 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 M0R129 80 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CCRL2O00421 344 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 ADAP00813 363 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 ADRA2AP08913 450 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 IRS1P35568 1242 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CRISP3P54108 245 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 DSTNP60981 165 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 TAP2Q03519 686 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 OR5AK3PQ8NH89 298 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 MYLIPQ8WY64 445 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 SLC25A19Q9HC21 320 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 RAB23Q9ULC3 237 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 FUT4P22083 530 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 HOXD12P35452 270 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 SEPHS1P49903 392 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 KCNJ8Q15842 424 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM201Q5SNT2 666 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 REEP3Q6NUK4 255 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 AKAP14Q86UN6 197 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 FAM46DQ8NEK8 389 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 DTD2Q96FN9 168 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 OR5M11Q96RB7 305 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 RACGAP1Q9H0H5 632 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 TAS2R16Q9NYV7 291 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD1-201ENST00000331462 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA0513O60268 411 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 DLGAP3O95886 979 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 GASTP01350 101 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 KLK1P06870 262 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 IL3P08700 152 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 CNR2P34972 360 aa21.51■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 CYP27C1Q4G0S4 372 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 ATAD3BQ5T9A4 648 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 ERAP2Q6P179 960 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 PTCHD4Q6ZW05 846 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3R3Q92569 461 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 COQ10AQ96MF6 247 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC32Q9BV29 185 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM165Q9HC07 324 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 A4GALTQ9NPC4 353 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 TAAR2Q9P1P5 351 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SAP18O00422 153 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP33O14559 1287 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SNPHO15079 494 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 TBX19O60806 448 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SOD1P00441 154 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 POU2F1P14859 743 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SYN1P17600 705 aa21.5■■□□□ 1.03
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