RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 FAM205BPQ63HN1 556 aa22.95■■□□□ 1.26
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PACS2-201ENST00000325438 SLC9A6Q92581 669 aa22.95■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.95■■□□□ 1.26
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PACS2-201ENST00000325438 UGT2B17O75795 530 aa22.95■■□□□ 1.26
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PACS2-201ENST00000325438 ADNP2Q6IQ32 1131 aa22.95■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 SETD6Q8TBK2 473 aa22.95■■□□□ 1.26
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PACS2-201ENST00000325438 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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PACS2-201ENST00000325438 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 ANK1P16157 1881 aa22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.93■■□□□ 1.26
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PACS2-201ENST00000325438 LYRM1O43325 122 aa22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 EFR3AQ14156 821 aa22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 OR4N4Q8N0Y3 316 aa22.93■■□□□ 1.26
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PACS2-201ENST00000325438 LRR1Q96L50 414 aa22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 PIP5K1AQ99755 562 aa22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 CDCP1Q9H5V8 836 aa22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 TMEM45AQ9NWC5 275 aa22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 RDH8Q9NYR8 311 aa22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 A3GALT2U3KPV4 340 aa22.93■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 MPZL2O60487 215 aa22.92■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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PACS2-201ENST00000325438 SPERTQ8NA61 448 aa22.92■■□□□ 1.26
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PACS2-201ENST00000325438 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.92■■□□□ 1.26
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PACS2-201ENST00000325438 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa22.92■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.92■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 TEX46H3BTG2 121 aa22.92■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 HMGCLP35914 325 aa22.92■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 MAGEA2P43356 314 aa22.92■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 ZMYND11Q15326 602 aa22.92■■□□□ 1.26
PACS2-201ENST00000325438 SSX1Q16384 188 aa22.92■■□□□ 1.26
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