RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302313.9

WDR48-201, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR48, Length 3,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-201ENST00000302313 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.9□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.9□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 PIF1Q9H611 641 aa6.9□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 HPF1Q9NWY4 346 aa6.9□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 C1orf109Q9NX04 203 aa6.9□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.9□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 VNN3Q9NY84 501 aa6.9□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.9□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.9□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 SERTM1A2A2V5 107 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 RGS10O43665 173 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 XPNPEP2O43895 674 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 GJB5O95377 273 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 MED26O95402 600 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 MT-ND2P03891 347 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 GALTP07902 379 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 IGFBP5P24593 272 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 DAPP51397 102 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 EPHA4P54764 986 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 TBX4P57082 545 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 ABHD18Q0P651 414 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 BTN1A1Q13410 526 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 GPM6BQ13491 265 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 GTF2H2Q13888 395 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 CAMK1Q14012 370 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 HFEQ30201 348 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 FAHD1Q6P587 224 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 SBSNQ6UWP8 590 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 BEND4Q6ZU67 534 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 METTL6Q8TCB7 284 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 USP7Q93009 1102 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 IGSF8Q969P0 613 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 FAM162AQ96A26 154 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 SUSD3Q96L08 255 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 ZBTB18Q99592 522 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 GAL3ST1Q99999 423 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 TCF25Q9BQ70 676 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 NTMT1Q9BV86 223 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 QSOX1O00391 747 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 ARHGEF9O43307 516 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 RGS14O43566 566 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 NDUFS3O75489 264 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 IGHA2P01877 340 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 ESR1P03372 595 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 PGRP06401 933 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 PRSS56P0CW18 603 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 HPGDP15428 266 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 MYL9P24844 172 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 TIE1P35590 1138 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 PPP3CCP48454 512 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 RING1Q06587 406 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 KCNAB1Q14722 419 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 SHHQ15465 462 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 RAB30Q15771 203 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 TMEM240Q5SV17 173 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 FBXL22Q6P050 247 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 TMEM107Q6UX40 140 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 UTS2BQ765I0 119 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 ST8SIA2Q92186 375 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 LINGO1Q96FE5 620 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 TMEM245Q9H330 911 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 FAM50BQ9Y247 325 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 DHRS7Q9Y394 339 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 PTGES3LE9PB15 166 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 GNGT2O14610 69 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 RAMP2O60895 175 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 CCNDBP1O95273 360 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 ADH1AP07327 375 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 ACSM4P0C7M7 580 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 FPR1P21462 350 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 ITGB8P26012 769 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 MAP2K4P45985 399 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 CLDN20P56880 219 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 SSPNQ14714 243 aa6.89□□□□□ -1.31
WDR48-201ENST00000302313 NR6A1Q15406 480 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms