RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 CRELD1Q96HD1 420 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 KATNBL1Q9H079 304 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 SNTG1Q9NSN8 517 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 DUX1O43812 170 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 OR4D2P58180 307 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.853e-6■■■□□ 16.7
LRP5-201ENST00000294304 PPP3R1P63098 170 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 MVKQ03426 396 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 MADCAM1Q13477 382 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 IL18R1Q13478 541 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 C5orf22Q49AR2 442 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 HSDL2Q6YN16 418 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 GALNT7Q86SF2 657 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 APBB3O95704 486 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 NADK2Q4G0N4 442 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 USP43Q70EL4 1123 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 C6orf120Q7Z4R8 191 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 SLC22A12Q96S37 553 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 TAS2R7Q9NYW3 318 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 COMMD9Q9P000 198 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 CLDN25C9JDP6 229 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 LAMTOR5O43504 91 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 IFI30P13284 250 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 HOXC13P31276 330 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 GJA8P48165 433 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 PROKR2Q8NFJ6 384 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ZBP1Q9H171 429 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ARHGEF15O94989 841 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 RNH1P13489 461 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 HHEXQ03014 270 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 MEP1AQ16819 746 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 BCL2L14Q9BZR8 327 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 LIPT1Q9Y234 373 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ZNF726A6NNF4 738 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 GPR39O43194 453 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 HEXBP07686 556 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 GALK1P51570 392 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 TLR1Q15399 786 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ADNP2Q6IQ32 1131 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 GAREM2Q75VX8 874 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 APIPQ96GX9 242 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 MYRFLQ96LU7 910 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 GABRA3P34903 492 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 HTRA1Q92743 480 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 APOOQ9BUR5 198 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 RDH14Q9HBH5 336 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 TCF7L1Q9HCS4 588 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 MARK1Q9P0L2 795 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 GP1BBP13224 206 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 GCAP28676 217 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ZBED5Q49AG3 693 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 IER5LQ5T953 404 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 KCNN1Q92952 543 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 SORT1Q99523 831 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 OR51I1Q9H343 314 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 METTL7AQ9H8H3 244 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ZNF222Q9UK12 451 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 LRRC42Q9Y546 428 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 PEX12O00623 359 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 SGCBQ16585 318 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 PDCD10Q9BUL8 212 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 TOR1BO14657 336 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ZNF33BQ06732 778 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 COLEC12Q5KU26 742 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 EMCNQ9ULC0 261 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP5-201ENST00000294304 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms