RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263966.7

USP13-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP13, Length 8,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-201ENST00000263966 BCL9O00512 1426 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 CLIC1O00299 241 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ZNF773Q6PK81 442 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 UBQLNLQ8IYU4 475 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 TXNDC15Q96J42 360 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 TLR10Q9BXR5 811 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ACTR3BQ9P1U1 418 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 IL3P08700 152 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 GNAO1P09471 354 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 NELL2Q99435 816 aa15.93■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 LRRTM2O43300 516 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 CSTAP01040 98 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 PGCP20142 388 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ZNF92Q03936 586 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 TSPAN4O14817 238 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 MSR1P21757 451 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ARSFP54793 590 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 OR5K1Q8NHB7 308 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 FAIMQ9NVQ4 179 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ATAD3CQ5T2N8 411 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 TTLL10Q6ZVT0 673 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 DEPDC5O75140 1603 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 GPR25O00155 361 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 RRADP55042 308 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 GPR153Q6NV75 609 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 LHFPL3Q86UP9 236 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 CMTM1Q8IZ96 169 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 TMEM209Q96SK2 561 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 BDKRB1P46663 353 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 AKR1C2P52895 323 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ACTA2P62736 377 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ACTG2P63267 376 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 MANEAQ5SRI9 462 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 SPATC1Q76KD6 591 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 LRIG1Q96JA1 1093 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 HERPUD2Q9BSE4 406 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 TLR4O00206 839 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 BANF1O75531 89 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 SNCGO76070 127 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 NMBRP28336 390 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 DIO2Q92813 273 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 C1orf21Q9H246 121 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 A0A1W2PPH5 198 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 MPPED2Q15777 294 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 UCN3Q969E3 161 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 TMEM109Q9BVC6 243 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 MAGEE1Q9HCI5 957 aa15.92■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 DDR1Q08345 913 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 LIN52Q52LA3 116 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ZNF366Q8N895 744 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 FBXW5Q969U6 566 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 MT-ND2P03891 347 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 RAB11BQ15907 218 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 NRROSQ86YC3 692 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 PLD5Q8N7P1 536 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 STEAP3Q658P3 488 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 PIGWQ7Z7B1 504 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ZNF649Q9BS31 505 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 GNG13Q9P2W3 67 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ACTC1P68032 377 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ACTA1P68133 377 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ARL16Q0P5N6 197 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 NR0B2Q15466 257 aa15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP13-201ENST00000263966 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms