RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SOX14O95416 240 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CD72P21854 359 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PDX1P52945 283 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ELOCQ15369 112 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TSTQ16762 297 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 COLEC12Q5KU26 742 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 MEDAGQ5VYS4 303 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 GAL3ST1Q99999 423 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PRODH2Q9UF12 536 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 STOML2Q9UJZ1 356 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 GMEB2Q9UKD1 530 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 A0A1W2PQU0 124 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 C7P10643 843 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PEPDP12955 493 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 EDNRAP25101 427 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 KCNC1P48547 511 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 COQ5Q5HYK3 327 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ASPGQ86U10 573 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 A8MU76 341 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 IL3P08700 152 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CLDN8P56748 225 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TBPL1P62380 186 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ARF5P84085 180 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 KCNAB2Q13303 367 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.553e-7■■■□□ 16.3
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF550Q7Z398 422 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 UBE2J2Q8N2K1 259 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RELTQ969Z4 430 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 FBXL20Q96IG2 436 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ASPNQ9BXN1 380 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 KLRF1Q9NZS2 232 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 EEDO75530 441 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SOX30O94993 753 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CTSAP10619 480 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PFKLP17858 780 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SNTA1Q13424 505 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ARFRP1Q13795 201 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 DSG2Q14126 1118 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 APCDD1Q8J025 514 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 THRSPQ92748 146 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 OR8D2Q9GZM6 311 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 HCSTQ9UBK5 93 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 NUMA1Q14980 2115 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 BPIP17213 487 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CD9P21926 228 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 DCDC1P59894 354 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CST9Q5W186 159 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SLC36A4Q6YBV0 504 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 CARM1Q86X55 608 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 SUN3Q8TAQ9 357 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PTERQ96BW5 349 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM80Q96HE8 168 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 DOHHQ9BU89 302 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TTC34A8MYJ7 566 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 NPIPA5E9PKD4 350 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PEX12O00623 359 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 S100A1P23297 94 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 F8A1P23610 371 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 BMPR1AP36894 532 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TAS2R43P59537 309 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 MCCC2Q9HCC0 563 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 NPIPA1Q9UND3 350 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 A0A1W2PRG6 482 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ABRAXAS2Q15018 415 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 YIPF7Q8N8F6 280 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 AASSQ9UDR5 926 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 C1orf226A1L170 272 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 J3QLW9 94 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 MID1O15344 667 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF19P17023 458 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 HK1P19367 917 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRS-201ENST00000262963 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms