RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 NR1H2P55055 460 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 SGCGQ13326 291 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 IRF4Q15306 451 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 SPARTQ8N0X7 666 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 CADM3Q8N126 398 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 AMER3Q8N944 861 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 TMIEQ8NEW7 156 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 PYURFQ96I23 114 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 CTRCQ99895 268 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 CD320Q9NPF0 282 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 RASSF1Q9NS23 344 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 RAD18Q9NS91 495 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 POLHQ9Y253 713 aa9.53□□□□□ -0.88
USP11-201ENST00000218348 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 A0A1W2PQU0 124 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 J3QRK9 145 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 MEN1O00255 615 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SCN2BO60939 215 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 APODP05090 189 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 POU2F1P14859 743 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CTRB1P17538 263 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 HSPB3Q12988 150 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 XKR5Q6UX68 686 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 NLRP8Q86W28 1048 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RAB8BQ92930 207 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 WDR26Q9H7D7 661 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RHCGQ9UBD6 479 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 EBF1Q9UH73 591 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TAF4O00268 1085 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 XPNPEP2O43895 674 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SCELO95171 688 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ALPLP05186 524 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 IDSP22304 550 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 IL32P24001 234 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DCTP40126 519 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PRIM2P49643 509 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 IL5RAQ01344 420 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 VMACQ2NL98 169 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 AGBL4Q5VU57 503 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ATG9BQ674R7 924 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 OR2L2Q8NH16 312 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PPCDCQ96CD2 204 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 MAP6Q96JE9 813 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 KCNK12Q9HB15 430 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.52□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 H0YIV9 168 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 NAGAP17050 411 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 KDELR2P33947 212 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ALDH3A2P51648 485 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PRKAG1P54619 331 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 HSD17B7P56937 341 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ABHD18Q0P651 414 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 FZD5Q13467 585 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 KCTD8Q6ZWB6 473 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 C17orf64Q86WR6 236 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 HORMAD1Q86X24 394 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms