RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fip1l1Q9D824 581 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xylt2Q9EPL0 865 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcea2Q9QVN7 299 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adam18Q9R157 719 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Racgap1Q9WVM1 628 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adamts20P59511 1906 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Herc6F2Z461 1003 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ces2hF6Z9B9 558 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Angpt2O35608 496 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 UgdhO70475 493 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myf5P24699 255 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdh4P39038 913 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1caP62137 330 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chsy3Q5DTK1 884 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clec4a4Q5YIR8 236 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc24a5Q8C261 501 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrp11Q8CB67 483 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp709Q8VC29 727 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Man2c1Q91W89 1039 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itfg1Q99KW9 610 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptdss1Q99LH2 473 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lypd2Q9DD23 127 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ern1Q9EQY0 977 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gsk3bQ9WV60 420 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ncor1Q60974 2453 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 BC034090A0A087WP46 1202 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1306A2BFL7 312 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5475D3YV11 175 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp558E9Q1J0 407 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r31L7N2F1 303 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grap2O89100 322 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 MyogP12979 224 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alg6Q3TAE8 507 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc22a23Q3UHH2 689 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyb5d2Q5SSH8 263 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vsx2Q61412 361 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Drd1Q61616 446 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifit3Q64345 403 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sdc3Q64519 442 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cr1lQ64735 483 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 UnkQ8BL48 810 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pithd1Q8BWR2 211 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbl3Q8C4J7 801 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pias2Q8C5D8 621 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr551Q8VG23 315 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpp6Q9Z218 804 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scgb2b17S4R2V3 82 aa11.22□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 CenpfE9Q3P4 2997 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gp5O08742 567 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 NumblO08919 604 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rdh5O55240 318 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Foxred1Q3TQB2 487 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sim2Q61079 657 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Carnmt1Q80UY1 400 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sephs1Q8BH69 392 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slitrk6Q8C110 840 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrgprb5Q91ZB9 322 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oosp1Q925U0 202 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Msh4Q99MT2 958 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp4f3Q99N16 524 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 IcmtQ9EQK7 283 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnase2bQ9QY48 354 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gdf2Q9WV56 428 aa11.21□□□□□ -0.61
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tox2A2A472 547 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm8444F6XS56 118 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm20441G3UYJ7 252 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 PdxpP60487 292 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2iP63280 158 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 FcamrQ2TB54 535 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc37a3Q3TIT8 494 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ica1lQ3TY65 431 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 MogQ61885 246 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gramd1bQ80TI0 738 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 DglucyQ8BH86 617 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpn2Q8VEJ1 310 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lgals8Q9JL15 316 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lbx2Q9WUN8 195 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm340F6RGI3 1242 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r13L7N1X2 831 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alox8O35936 677 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sp3O70494 783 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 DdcO88533 480 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 CfpP11680 464 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dsc2P55292 902 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q3U6N9 222 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nqo1Q64669 274 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 C2cd4bQ80XU5 340 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pgs1Q8BHF7 553 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifnl3Q8CGK6 193 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttc23Q8CHY7 488 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 PyurfQ9D1C3 112 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem35aQ9D328 167 aa11.21□□□□□ -0.62
Herc3-201ENSMUST00000031823 RgccQ9DBX1 137 aa11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.4 ms