RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Idh2P54071 452 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EpycP70186 322 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igfbp5Q07079 271 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MocosQ14CH1 862 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr1d2Q60674 576 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il1rapQ61730 570 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtprcapQ64697 197 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt2b35Q8BJL9 529 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Angptl7Q8R1Q3 337 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r215Q8R264 300 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r84Q8R284 318 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1093Q8VF14 322 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NwcQ9CQI4 244 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Senp8Q9D2Z4 221 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PlgrktQ9D3P8 147 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9DAD0 168 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmg2Q9EST4 264 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Herpud2Q9JJC9 404 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hapln1Q9QUP5 356 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r114E9Q281 856 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm44G3UW88 330 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a8O35308 492 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Npc1O35604 1277 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl6O88848 186 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syn1O88935 706 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fcgr2P08101 330 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpa3P15089 417 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htr1bP28334 386 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mkl2P59759 1080 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbx1P82976 418 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vipr1P97751 459 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Samd12Q0VE29 161 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec24aQ3U2P1 1090 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp30Q3UN04 517 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist2h2acQ64523 129 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tha1Q6XPS7 400 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiss1Q6Y4S4 130 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamtsl4Q80T21 1036 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrde2Q80XC6 1172 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A730061H03RikQ8BGD2 154 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PgghgQ8BP56 690 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gk5Q8BX05 534 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekhn1Q8C886 359 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc27Q8CFP6 273 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr729Q8VET4 323 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r71Q8VIC0 307 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chil4Q91Z98 402 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcne2Q9D808 123 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptges3lQ9D9A7 131 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc23a2Q9EPR4 648 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gipc2Q9Z2H7 314 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 F8Q06194 2319 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plxnd1Q3UH93 1925 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv6-29A0A0G2JEI6 115 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AccsA2AIG8 502 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1188A2AV10 312 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup6A2AV72 179 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a54B1AUS6 473 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhcr7O88455 471 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P06324 132 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VldlrP98156 873 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xrra1Q3U3V8 786 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf223Q3UV31 285 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem151bQ68FE7 561 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptx4Q6RUU0 478 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1015Q7TR94 312 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asb2Q8K0L0 634 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GabrpQ8QZW7 440 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam20bQ8VCS3 409 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700034I23RikQ9D9Q3 184 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TrehQ9JLT2 576 aa12.14□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21885A0A286YDN8 145 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lcn5A2AJB7 192 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata31d1cE9QAF1 853 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnk1O08581 336 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pias3O54714 628 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a8O88909 537 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bmp7P23359 430 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnh6Q32ME0 950 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ulk3Q3U3Q1 472 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11492Q5ND19 536 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdcd4Q61823 469 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmbox1Q8BJA3 419 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ckap4Q8BMK4 575 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TtpaQ8BWP5 278 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r30Q8R2D2 302 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr677Q8VF06 312 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q99LU8 229 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4f3Q99N16 524 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arpc5lQ9D898 153 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lat2Q9JHL0 203 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ate1Q9Z2A5 516 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Enthd1E9Q1Z2 618 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r168K7N6B6 309 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mid1O70583 680 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hipk1O88904 1210 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fcgr1P26151 404 aa12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.7 ms