RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PDHA2P29803 388 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PIK3CBP42338 1070 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PLIN5Q00G26 463 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 LSAMPQ13449 338 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP19Q14CB8 494 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 MYOCQ99972 504 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 FZD3Q9NPG1 666 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ATXN10Q9UBB4 475 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa24.33■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEB17A8MXT2 336 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 DPM1O60762 260 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 POP7O75817 140 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKD3O94806 890 aa24.32■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 RPN2P04844 631 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 THEGLP0DJG4 465 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PEX19P40855 299 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS6KA3P51812 740 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 TBPL1P62380 186 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 FGL2Q14314 439 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa24.32■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 HIPK1Q86Z02 1210 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO30Q8TB52 745 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CYGBQ8WWM9 190 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 NCLNQ969V3 563 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 MTERF3Q96E29 417 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PANX1Q96RD7 426 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A13Q9NSD5 602 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 DKK4Q9UBT3 224 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 G3V2T6 193 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CLIC1O00299 241 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 NPPBP16860 134 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 KELP23276 732 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CCSMST1Q4G0I0 132 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PYCR3Q53H96 274 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC157Q569K6 752 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CPTPQ5TA50 214 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 LCTLQ6UWM7 567 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ENPP6Q6UWR7 440 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 XKR5Q6UX68 686 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A45Q8N413 288 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 OR13H1Q8NG92 308 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 HUS1BQ8NHY5 278 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 RAD51AP1Q96B01 352 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 EGLN2Q96KS0 407 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 TBCDQ9BTW9 1192 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 DUSP26Q9BV47 211 aa24.31■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PKD1L2Q7Z442 2459 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP20O60882 483 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 AKT2P31751 481 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 RAE1P78406 368 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 VMACQ2NL98 169 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 DOK6Q6PKX4 331 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PDZD3Q86UT5 571 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS12Q86WS5 348 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SYTL1Q8IYJ3 562 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 NEIL2Q969S2 332 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 BMFQ96LC9 184 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC17A9Q9BYT1 436 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR27Q9NS67 375 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ATAD3AQ9NVI7 634 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK4P11802 303 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINB1P30740 379 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CDKN2CP42773 168 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN2P57739 230 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ESRRGP62508 458 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS21P63220 83 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP2R2BQ00005 443 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 TAP2Q03519 686 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 NXPE4Q6UWF7 544 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF547Q8IVP9 402 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PHACTR4Q8IZ21 702 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
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