RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564228.5

TCF4-222, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCF4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-222	ENST00000564228	FCAR	P24071	287 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	EPHA2	P29317	976 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CD70	P32970	193 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ALDH9A1	P49189	494 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	RORC	P51449	518 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ITGA1	P56199	1179 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ABHD18	Q0P651	414 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	STX19	Q8N4C7	294 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ENKUR	Q8TC29	256 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GPR137	Q96N19	417 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PSKH2	Q96QS6	385 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	BEX2	Q9BXY8	128 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PDF	Q9HBH1	243 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ASIC5	Q9NY37	505 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CMAHP	Q9Y471	501 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	AKR7A2	O43488	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	C9	P02748	559 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CYP17A1	P05093	508 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	FABP3	P05413	133 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	IFI30	P13284	250 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	HLA-F	P30511	346 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ARF5	P84085	180 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	RGS1	Q08116	209 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	DHCR24	Q15392	516 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	NR6A1	Q15406	480 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	VIT	Q6UXI7	678 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228		Q7L0L9	218 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	KIF18B	Q86Y91	864 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	UBE2F	Q969M7	185 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CCDC120	Q96HB5	630 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	EPYC	Q99645	322 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TM9SF2	Q99805	663 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	KXD1	Q9BQD3	176 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	REEP1	Q9H902	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	RGS5	O15539	181 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	NDUFA2	O43678	99 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TSPAN12	O95859	305 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	LGI1	O95970	557 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	STS	P08842	583 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CSF3	P09919	207 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ADH5	P11766	374 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	LAMP2	P13473	410 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TNNI3	P19429	210 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	KIR2DL3	P43628	341 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ARSD	P51689	593 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PER3	P56645	1201 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	B2M	P61769	119 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	DSC2	Q02487	901 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	RUNX1T1	Q06455	604 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PARM1	Q6UWI2	310 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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