RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CD72P21854 359 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PMS2P3Q13401 168 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 BOD1Q96IK1 185 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PIGUQ9H490 435 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NRP2O60462 931 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OR4F21O95013 312 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CHRNB2P17787 502 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC5A2P31639 672 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MAN2A2P49641 1150 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ARPC4P59998 168 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CD47Q08722 323 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GAS6Q14393 721 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 XKR5Q6UX68 686 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MREGQ8N565 214 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 IL17RCQ8NAC3 791 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SCAMP4Q969E2 229 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NXNL1Q96CM4 212 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MFSD3Q96ES6 412 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 AGAP4Q96P64 663 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OR1F2PQ96R84 312 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF831Q5JPB2 1677 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 A0A0D9SEW6 157 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 C4orf47A7E2U8 309 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LINC01387J3KSC0 135 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 HCRTR2O43614 444 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 HCN1O60741 890 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF3P17036 446 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PSMD7P51665 324 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FOXK2Q01167 660 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GUCY1A3Q02108 690 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FADDQ13158 208 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF846Q147U1 533 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL12Q53G59 568 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 RHEBL1Q8TAI7 183 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NINJ1Q92982 152 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SEPHS2Q99611 448 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CACNG4Q9UBN1 327 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PLSCR5A0PG75 271 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CSTAP01040 98 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ANXA8P13928 327 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 AOC1P19801 751 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 UQCRC2P22695 453 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GDF1P27539 372 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MSX1P28360 303 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MPP1Q00013 466 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TEKQ02763 1124 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TAZQ16635 292 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 KCNN1Q92952 543 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FGF21Q9NSA1 209 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FUOMA2VDF0 154 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 A6NIZ1 184 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PDLIM1O00151 329 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MANBAO00462 879 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PRODHO43272 600 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CSO75390 466 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 RFPL1O75677 317 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TNFSF15O95150 251 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GLB1P16278 677 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PBX2P40425 430 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 EIF1P41567 113 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 RAP1BP61224 184 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 RAP1AP62834 184 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MYBPHQ13203 477 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ARL6IP1Q15041 203 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TIGD6Q17RP2 521 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 C16orf87Q6PH81 154 aa7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms