RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537529.6

MKS1-204, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-204ENST00000537529 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.95□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 GABRG3Q99928 467 aa14.95□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.95□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.95□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.95□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 KRT84Q9NSB2 600 aa14.95□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.95□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.95□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.95□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 PDPK1O15530 556 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ARAFP10398 606 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CASP9P55211 416 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CSNK1G2P78368 415 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CDK6Q00534 326 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 IL5RAQ01344 420 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 FAHD1Q6P587 224 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ADCK2Q7Z695 626 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ZNF347Q96SE7 839 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 FANCEQ9HB96 536 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 EBF1Q9UH73 591 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 SLC1A7O00341 560 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ADAMDEC1O15204 470 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 GSTM2P28161 218 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ALDH9A1P49189 494 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ADPRHP54922 357 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 RAPSNQ13702 412 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TTLQ8NG68 377 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ZNF566Q969W8 418 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 APOL4Q9BPW4 351 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 APOOQ9BUR5 198 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 XKR8Q9H6D3 395 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 PREBQ9HCU5 417 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 PRR19A6NJB7 356 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 LATO43561 262 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CLEC3AO75596 197 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 OPN1SWP03999 348 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CCDC159P0C7I6 412 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CYP4B1P13584 511 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 DSTNP60981 165 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TUBA3CQ13748 450 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 GPR107Q5VW38 600 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TAMM41Q96BW9 452 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 DOK1Q99704 481 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 S1PR5Q9H228 398 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TRBC2A0A5B9 178 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 HOXB2P14652 356 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 ITGA2P17301 1181 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 AGXTP21549 392 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 RRM2P31350 389 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 NUP107P57740 925 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CDK5R2Q13319 367 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 CLCA4Q14CN2 919 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 SPARTQ8N0X7 666 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-204ENST00000537529 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms