RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	GZMA	P12544	262 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LIF	P15018	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	DNASE1	P24855	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CCR3	P51677	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	AP3M2	P53677	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	HUNK	P57058	714 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CX3CL1	P78423	397 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GCNT1	Q02742	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	KRT81	Q14533	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MAPK6	Q16659	721 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MIS12	Q9H081	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908		E9PI62	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OGT	O15294	1046 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	BUB1	O43683	1085 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RTN2	O75298	545 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PALM	O75781	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PIGN	O95427	931 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TNNI1	P19237	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	IL11	P20809	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PCGF2	P35227	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TIMP3	P35625	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TFDP1	Q14186	410 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	METTL13	Q8N6R0	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908		Q9Y3F1	56 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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