RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528309.5

GATD1-208, Transcript of glutamine amidotransferase like class 1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene GATD1, Length 510 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GATD1-208	ENST00000528309	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	SNX31	Q8N9S9	440 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	OR2L5	Q8NG80	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
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GATD1-208	ENST00000528309	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	CD274	Q9NZQ7	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309		A0A0G2JN53	185 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	ZNF24	P17028	368 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	HSPA7	P48741	367 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	PLA2G16	P53816	162 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	MTTP	P55157	894 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	CAV1	Q03135	178 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	LAPTM5	Q13571	262 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	OR4D1	Q15615	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	C3AR1	Q16581	482 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	PDK4	Q16654	411 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		13.72	□□□□□ -0.21
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GATD1-208	ENST00000528309	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	SIAH3	Q8IW03	269 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	KIAA1191	Q96A73	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	SERINC2	Q96SA4	455 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	RNF112	Q9ULX5	631 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
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GATD1-208	ENST00000528309	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	ENO4	A6NNW6	628 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	ASNA1	O43681	348 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	SMS	P52788	366 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	PLTP	P55058	493 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	GPX6	P59796	221 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	DOC2A	Q14183	400 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21	2e-6	■■■□□ 15.2
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GATD1-208	ENST00000528309	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		13.71	□□□□□ -0.21
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GATD1-208	ENST00000528309	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
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GATD1-208	ENST00000528309	CHST11	Q9NPF2	352 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GATD1-208	ENST00000528309	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	PRAMEF4	O60810	478 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	CTNS	O60931	367 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	ZFAND5	O76080	213 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	ABO	P16442	354 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	AGA	P20933	346 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	CRABP2	P29373	138 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	CASQ1	P31415	396 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	STX2	P32856	288 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	KCNC1	P48547	511 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GATD1-208	ENST00000528309	LIM2	P55344	173 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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