RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GCNT1Q02742 428 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 DSC1Q08554 894 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB17Q13105 803 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 RAPSNQ13702 412 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 LAMB3Q13751 1172 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF234Q14588 700 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TWIST1Q15672 202 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CEBPEQ15744 281 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 STX1AQ16623 288 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CA9Q16790 459 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM35AQ53FP2 167 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP17Q68EM7 881 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PM20D1Q6GTS8 502 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OR4A47Q6IF82 309 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 RTN4RL2Q86UN3 420 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MAP7D3Q8IWC1 876 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF679Q8IYX0 411 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 RNF149Q8NC42 400 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NPEPL1Q8NDH3 523 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OR5M8Q8NGP6 311 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 RNF128Q8TEB7 428 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 HAS2Q92819 552 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ESAMQ96AP7 390 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 EME1Q96AY2 570 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZMYND12Q9H0C1 365 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CUEDC2Q9H467 287 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ACKR4Q9NPB9 350 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FANCFQ9NPI8 374 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM30AQ9NV96 361 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PADI3Q9ULW8 664 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SNX6Q9UNH7 406 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SH3GLB1Q9Y371 365 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TMED5Q9Y3A6 229 aa2.09□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 USP47Q96K76 1375 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SBF1O95248 1867 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TRPM7Q96QT4 1865 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SCN7AQ01118 1682 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TRAV18A0A075B6X5 111 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1B0GUL7 405 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 XKRY2A2RUG3 117 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 I6L893 689 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CCSO14618 274 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 NME6O75414 186 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 STBD1O95210 358 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PIGNO95427 931 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GSRP00390 522 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CALCBP10092 127 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FUT1P19526 365 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 S1PR1P21453 382 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CDKN1AP38936 164 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CCR4P51679 360 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 VCPP55072 806 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CDKL1Q00532 357 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GALK2Q01415 458 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 DRP2Q13474 957 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 KARSQ15046 597 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PDK3Q15120 406 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SYCP1Q15431 976 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 BOLA3Q53S33 107 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ARMCX4Q5H9R4 360 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 FSCBQ5H9T9 825 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 IL17RELQ6ZVW7 336 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ARMCX2Q7L311 632 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 AMIGO2Q86SJ2 522 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GPSM1Q86YR5 675 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 TDHQ8IZJ6 230 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 THEM5Q8N1Q8 247 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OR4K1Q8NGD4 311 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OR52I2Q8NH67 350 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 OR5R1Q8NH85 324 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 GANCQ8TET4 914 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 C17orf50Q8WW18 174 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 IGFBPL1Q8WX77 278 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 SEMA4DQ92854 862 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 CCM2Q9BSQ5 444 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 POLD4Q9HCU8 107 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 EXOC1Q9NV70 894 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 EPHA6Q9UF33 1036 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 IL36AQ9UHA7 158 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 RNF150Q9ULK6 438 aa2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PDE4D-218ENST00000509368 PLA2G4CQ9UP65 541 aa2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms