RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf61A6NNL5 157 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SURF4O15260 269 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 REC8O95072 547 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 STBD1O95210 358 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINF2P08697 491 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GIFP27352 417 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CCR4P51679 360 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 KRT31Q15323 416 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SLC43A2Q8N370 569 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 DCLK2Q8N568 766 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 LEMD2Q8NC56 503 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CCSO14618 274 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF195O14628 629 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 OGTO15294 1046 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CPNE6O95741 557 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CT45A8P0DMV1 189 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CT45A9P0DMV2 189 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GJB2P29033 226 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SSTP61278 116 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CCZ1BP86790 482 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM64Q6YI46 380 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP14Q86W24 1093 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 S1PR3Q99500 378 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SSX3Q99909 188 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ABCG4Q9H172 646 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 S100A14Q9HCY8 104 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf81C9J6K1 198 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SSX5O60225 188 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 B3GALNT1O75752 331 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CEACAM4O75871 244 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 STAM2O75886 525 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 C4BPBP20851 252 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SFNP31947 248 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GNB1P62873 340 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 KDM8Q8N371 416 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SMPDL3AQ92484 453 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GLYATL1Q969I3 302 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 LRR1Q96L50 414 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 DUX3Q96PT4 197 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GANQ9H2C0 597 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PR80 420 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP73A6NFT4 308 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 IFITM10A6NMD0 228 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CHEK1O14757 476 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 P2RX6O15547 441 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 FGF19O95750 216 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PGK2P07205 417 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MYOGP15173 224 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 B4GALT1P15291 398 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH3B1P43353 468 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-BQ31612 363 aa6.65□□□□□ -1.34
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