RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484822.1

RXRA-203, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RXRA, Length 5,215 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-203ENST00000484822 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 FLRT2O43155 660 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 MPIP34949 423 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SEC23BQ15437 767 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 KIAA1191Q96A73 305 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 NXPE2Q96DL1 559 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 LHPPQ9H008 270 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 DUXAA6NLW8 204 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SLC1A7O00341 560 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CFIP05156 583 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 ZNF20P17024 532 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CLCN7P51798 805 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CHAF1BQ13112 559 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 NRG4Q8WWG1 115 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 TRIB2Q92519 343 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 RCBTB2O95199 551 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 ATP4BP51164 291 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 TAS2R50P59544 299 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 GINS1Q14691 196 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 KIF18BQ86Y91 864 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 ANKFN1Q8N957 763 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 GATA6Q92908 595 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 C7P10643 843 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 PGDP52209 483 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 FGFBP1Q14512 234 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 PTPRCAPQ14761 206 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 PON3Q15166 354 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SPIN4Q56A73 249 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 PEBP4Q96S96 227 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 OR2AG1Q9H205 316 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 NCDNQ9UBB6 729 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 LCHNA4D1U4 455 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 H3BMQ9 156 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 ZNF208O43345 1280 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 OR4D2P58180 307 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 DNAJB13P59910 316 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 ST3GAL3Q11203 375 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 PDGFRLQ15198 375 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SERINC5Q86VE9 423 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 OR8K3Q8NH51 312 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 COG8Q96MW5 612 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 DERL2Q9GZP9 239 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 IFT52Q9Y366 437 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 A0A1B0GVT2 93 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 A0A1W2PPK0 400 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CENPBD1B2RD01 187 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 VILLO15195 856 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 SLC19A2O60779 497 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CRYZL1O95825 349 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 C6orf47O95873 294 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CDK4P11802 303 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 GSTM2P28161 218 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-203ENST00000484822 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RXRA-203ENST00000484822 MT-ND5P03915 603 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-203ENST00000484822 TUBG1P23258 451 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-203ENST00000484822 GADD45AP24522 165 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-203ENST00000484822 INCA1Q0VD86 236 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-203ENST00000484822 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms