RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474831.5

LAMTOR4-208, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, human

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ING2	Q9H160	280 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CHD6	Q8TD26	2715 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ATRX	P46100	2492 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831		A0A1W2PS29	197 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	13.11	□□□□□ -0.31	7e-11	■■■■■ 36.1
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UGDH	O60701	494 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	COX6A1	P12074	109 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PIK3CB	P42338	1070 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SSR2	P43308	183 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MTTP	P55157	894 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LIM2	P55344	173 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HMGCS1	Q01581	520 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RHD	Q02161	417 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LCP2	Q13094	533 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PCOLCE	Q15113	449 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LIPM	Q5VYY2	423 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DOK4	Q8TEW6	326 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UBE2E3	Q969T4	207 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TLCD1	Q96CP7	247 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PGM2	Q96G03	612 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAR2	Q96K12	515 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SCN2A	Q99250	2005 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831		A8MUA0	341 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CYR61	O00622	381 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ITM2A	O43736	263 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C1QL1	O75973	258 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ITGB2	P05107	769 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	BPGM	P07738	259 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GSTM2	P28161	218 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RAP1GDS1	P52306	607 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RAB38	P57729	211 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TTMP	Q5BVD1	217 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C18orf63	Q68DL7	685 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMEM205	Q6UW68	189 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	METTL6	Q8TCB7	284 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SERINC2	Q96SA4	455 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ACPT	Q9BZG2	426 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831		A0A0A6YYD5	115 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	URAD	A6NGE7	173 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	B3GALT2	O43825	422 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TRIM13	O60858	407 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SCEL	O95171	688 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ESRRB	O95718	433 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ACPP	P15309	386 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SERPINB4	P48594	390 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IFT88	Q13099	833 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLAMF1	Q13291	335 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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