RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CEACAM20Q6UY09 585 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf107Q6ZR85 190 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CTAGE6Q86UF2 777 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6M1Q8NGM8 313 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4L1Q8NH43 312 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MCHR2Q969V1 340 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM45BQ96B21 275 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 COG4Q9H9E3 785 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 WNT16Q9UBV4 365 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 BCAP29Q9UHQ4 241 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.532e-6■■■□□ 18.8
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PPI3 338 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OVOL3O00110 214 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4F21O95013 312 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GLUD1P00367 558 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP1B1P05026 303 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CDH1P12830 882 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 DPP4P27487 766 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GLUD2P49448 558 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 COL10A1Q03692 680 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAF2Q12933 501 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR50Q13585 617 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 KIR2DS3Q14952 304 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM132DQ14C87 1099 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 XKR3Q5GH77 459 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 PMF1Q6P1K2 205 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 C5orf24Q7Z6I8 188 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 BPIFA2Q96DR5 249 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 NSL1Q96IY1 281 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 C4orf36Q96KX1 117 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 C4orf45Q96LM5 186 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 PSKH2Q96QS6 385 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 AGPAT1Q99943 283 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 VCX2Q9H322 139 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 OCIAD1Q9NX40 245 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 RDH8Q9NYR8 311 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SPACA6W5XKT8 324 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 XKRY2A2RUG3 117 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 A8MUI8 341 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SURF6O75683 361 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0754O94854 1291 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MT-ND2P03891 347 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CALB2P22676 271 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PAX7P23759 505 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNCP24863 283 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGFRP43088 359 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PCYT1AP49585 367 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 INHBCP55103 352 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC57Q2TAC2 916 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MPPE1Q53F39 396 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MORN5Q5VZ52 161 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LIPJQ5W064 366 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4C11Q6IEV9 310 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM64Q6YI46 380 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GGNQ86UU5 652 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SFR1Q86XK3 245 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 OR13C3Q8NGS6 347 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TMED6Q8WW62 240 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC47A1Q96FL8 570 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms