RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473244.5

MED15-222, Transcript of mediator complex subunit 15, human

TSL 1 (best)

Gene MED15, Length 2,733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED15-222	ENST00000473244		E7EQ34	232 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SYN3	O14994	580 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	MSL3P1	P0C860	447 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	ITGB7	P26010	798 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	IRF8	Q02556	426 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SCARB2	Q14108	478 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	ADGRF1	Q5T601	910 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	TRIM63	Q969Q1	353 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	FRMD6	Q96NE9	622 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	CITED4	Q96RK1	184 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	CDRT1	O95170	752 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	GADD45G	O95257	159 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	GPR33	Q49SQ1	333 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	BHMT	Q93088	406 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SEC14L5	O43304	696 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	HIST1H2AD	P20671	130 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	HMGA2	P52926	109 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	RUNX1T1	Q06455	604 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	FAP	Q12884	760 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	GPR17	Q13304	367 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	HCST	Q9UBK5	93 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SOX14	O95416	240 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	PCSK2	P16519	638 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	GPC1	P35052	558 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	HNMT	P50135	292 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	XKR6	Q5GH73	641 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	PHC2	Q8IXK0	858 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	GPR156	Q8NFN8	814 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SNAPC3	Q92966	411 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	18.78	■□□□□ 0.6	3e-6	■□□□□ 10.4
MED15-222	ENST00000473244	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	OR6C75	A6NL08	312 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	C8G	P07360	202 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	CSK	P41240	450 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	AP1S1	P61966	158 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	NKX3-2	P78367	333 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	DOC2A	Q14183	400 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	SUN5	Q8TC36	379 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	GON7	Q9BXV9	100 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MED15-222	ENST00000473244	LRRTM2	O43300	516 aa		18.77	■□□□□ 0.59
MED15-222	ENST00000473244	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.59
MED15-222	ENST00000473244	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		18.77	■□□□□ 0.59
MED15-222	ENST00000473244	AKR1A1	P14550	325 aa		18.77	■□□□□ 0.59
MED15-222	ENST00000473244	PRIM2	P49643	509 aa		18.77	■□□□□ 0.59
MED15-222	ENST00000473244	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		18.77	■□□□□ 0.59
MED15-222	ENST00000473244	RTP2	Q5QGT7	225 aa		18.77	■□□□□ 0.59
MED15-222	ENST00000473244	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		18.77	■□□□□ 0.59
MED15-222	ENST00000473244	XKRX	Q6PP77	449 aa		18.77	■□□□□ 0.59
MED15-222	ENST00000473244	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		18.77	■□□□□ 0.59

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