RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 COL12A1Q99715 3063 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 B3GALT2O43825 422 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 GSTM2P28161 218 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP2R1BP30154 601 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 PIK3CGP48736 1102 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 RAB38P57729 211 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC26A5P58743 744 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 E2F2Q14209 437 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC29A2Q14542 456 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 QSOX2Q6ZRP7 698 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 LAS2Q8IYD9 372 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 CDK15Q96Q40 435 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 PRDM9Q9NQV7 894 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 ABHD2P08910 425 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 MTTPP55157 894 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 LIM2P55344 173 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 TLR1Q15399 786 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 ABHD17BQ5VST6 288 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 M1APQ8TC57 530 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 SERINC2Q96SA4 455 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 IPPKQ9H8X2 491 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 ACTR8Q9H981 624 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD10Q9NXR5 420 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 STMN3Q9NZ72 180 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 DYTNA2CJ06 578 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 E2F3O00716 465 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 RBP1P09455 135 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 SBK3P0C264 359 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 EXT1Q16394 746 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 BEST3Q8N1M1 668 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 HUS1BQ8NHY5 278 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.4■■□□□ 1.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 OR7A17O14581 309 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 TSPAN8P19075 237 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 CNTFP26441 200 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 TSFMP43897 325 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 TNFSF10P50591 281 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 NEK2P51955 445 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS13P62277 151 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ACER2Q5QJU3 275 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 OR52B6Q8NGF0 335 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 GRHL3Q8TE85 626 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 HAS2Q92819 552 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 UBE2E3Q969T4 207 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 MMP25Q9NPA2 562 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 DAPP1Q9UN19 280 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 GOLGA8RI6L899 631 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 CYR61O00622 381 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 SMIM24O75264 130 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ID2Q02363 134 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDH1Q08174 1060 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC13A2Q13183 592 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNC2Q96PR1 638 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 CDCP1Q9H5V8 836 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 DMRT3Q9NQL9 472 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 TBK1Q9UHD2 729 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A088AWK7 358 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC189A1A4V9 331 aa22.37■■□□□ 1.17
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