RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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RABGEF1-203ENST00000439720 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
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RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0G2JPF8 293 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35F4A4IF30 521 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 I6L893 689 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1I1O60431 355 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
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RABGEF1-203ENST00000439720 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 UROSP10746 265 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NPR3P17342 541 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF81P51508 661 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN20P56880 219 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 VLDLRP98155 873 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4F8P98187 520 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAPC1Q16533 368 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM209BQ5JX69 171 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD9AQ99638 391 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf109Q9NX04 203 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF112Q9ULX5 631 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRSQ13332 1948 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PIPSLA2A3N6 862 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LYRM1O43325 122 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PROM1O43490 865 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CDRT1O95170 752 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMP1P01033 207 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 STAG3L1P0CL83 205 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKAR1AP10644 381 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZP3P21754 424 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 F8A1P23610 371 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AKT1P31749 480 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEA2P43356 314 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ABATP80404 500 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-203ENST00000439720 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR7G3Q8NG95 312 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CRELD1Q96HD1 420 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-203ENST00000439720 REEP1Q9H902 201 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMD3O43242 534 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FZD6O60353 706 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-203ENST00000439720 EXOC2Q96KP1 924 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-203ENST00000439720 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RBP7Q96R05 134 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PPL8 197 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR182O15218 404 aa8.06□□□□□ -1.12
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