RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 CACNA1SQ13698 1873 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 UNCXA6NJT0 531 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NRP1O14786 923 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DFNA5O60443 496 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FKTNO75072 461 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MTX2O75431 263 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR1E2P47887 323 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC6A9P48067 706 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 AGTR2P50052 363 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SMSP52788 366 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR12D2P58182 307 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NOGQ13253 232 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RIN1Q13671 783 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CYS1Q717R9 158 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CAMKVQ8NCB2 501 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF675Q8TD23 568 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NDC1Q9BTX1 674 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MND1Q9BWT6 205 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NANSQ9NR45 359 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CENPMQ9NSP4 180 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 VNN2O95498 520 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DSTNP60981 165 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MS4A2Q01362 244 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CAP1Q01518 475 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PTGR1Q14914 329 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ABHD13Q7L211 337 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KBTBD6Q86V97 674 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DTX3Q8N9I9 347 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRM-202ENST00000400053 NFKBIDQ8NI38 313 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PMEPA1Q969W9 287 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SMOQ99835 787 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KATNBL1Q9H079 304 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MKS1Q9NXB0 559 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TJP1Q07157 1748 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GVI7 797 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 M0R233 179 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 VAMP1P23763 118 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRM-202ENST00000400053 CD97P48960 835 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CHAF1BQ13112 559 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NFE2L1Q14494 772 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CHADLQ6NUI6 762 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FUT10Q6P4F1 479 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RBP7Q96R05 134 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC29A1Q99808 456 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ADAP2Q9NPF8 381 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 E2F3O00716 465 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MUSKO15146 869 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GBAP04062 536 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BCHEP06276 602 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ALPIP09923 528 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GM2AP17900 193 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RFC2P35250 354 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 EMX2Q04743 252 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ENPP2Q13822 863 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SEMA3AQ14563 771 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GPAT4Q86UL3 456 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR5J2Q8NH18 312 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LRCH3Q96II8 777 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CD93Q9NPY3 652 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SCAMP1O15126 338 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 AHSA1O95433 338 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ITGA5P08648 1049 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CDK4P11802 303 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SELPP16109 830 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PROZP22891 400 aa8.56□□□□□ -1.04
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