RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PRKACGP22612 351 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PTGER3P43115 390 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MAPKAPK2P49137 400 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RORCP51449 518 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DGKQP52824 942 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LIMK1P53667 647 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN8P56748 225 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF33BQ06732 778 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF235Q14590 738 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SYT16Q17RD7 645 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 AAK1Q2M2I8 961 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SMUG1Q53HV7 270 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM240Q5SV17 173 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NETO1Q8TDF5 533 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC7A6Q92536 515 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 AP3S1Q92572 193 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NELL1Q92832 810 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LINGO1Q96FE5 620 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA17Q96L03 361 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 Q96MT0 163 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR2A14Q96R47 310 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ACOX2Q99424 681 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GPR21Q99679 349 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MPP6Q9NZW5 540 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF225Q9UK10 706 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FAM50BQ9Y247 325 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRSQ13332 1948 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 H0Y8X5 98 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CDC7O00311 574 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SEC14L5O43304 696 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LGI1O95970 557 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GLUD1P00367 558 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MMP2P08253 660 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ADORA3P0DMS8 318 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SPNP16150 400 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CPN2P22792 545 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PRPH2P23942 346 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FMO4P31512 558 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RHAGQ02094 409 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TNK1Q13470 666 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ODF1Q14990 250 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 QPRTQ15274 297 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CARTPTQ16568 116 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RTP2Q5QGT7 225 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IL31Q6EBC2 164 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CBLL1Q75N03 491 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RELTQ969Z4 430 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NTMT1Q9BV86 223 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IPPKQ9H8X2 491 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 BRCA2P51587 3418 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MTMR11A4FU01 709 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.9□□□□□ -1.3
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