RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 ACAP2Q15057 778 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 EXT1Q16394 746 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 FAM153CQ494X1 144 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 XKR6Q5GH73 641 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TIFABQ6ZNK6 161 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MREGQ8N565 214 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GRHL3Q8TE85 626 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 WDR34Q96EX3 536 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM10Q96HG1 83 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 FAR2Q96K12 515 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ATOH8Q96SQ7 321 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LPAR4Q99677 370 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CD244Q9BZW8 370 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RNF32Q9H0A6 362 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 21.4
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SGMS1-201ENST00000361543 NT5DC2Q9H857 520 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 COPG2Q9UBF2 871 aa7.2□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 RAB21Q9UL25 225 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ASB1Q9Y576 335 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 A0A0G2JN53 185 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 BLACEA4D250 179 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC151A5D8V7 595 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LRIT2A6NDA9 550 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 OR5H15A6NDH6 313 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 A8MUI8 341 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.19□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC26A5P58743 744 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 NAA20P61599 178 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 BTN3A2P78410 334 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 IRF9Q00978 393 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 IRF8Q02556 426 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CHIT1Q13231 466 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LAPTM5Q13571 262 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 INAQ16352 499 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ACER2Q5QJU3 275 aa7.19□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 ISCA2Q86U28 154 aa7.19□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 BCORP1Q8N888 145 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 OR2L5Q8NG80 312 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 M1APQ8TC57 530 aa7.19□□□□□ -1.26
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