RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 MOSPD2Q8NHP6 518 aa16■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 LEUTXA8MZ59 168 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PRSS44E7EML9 344 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PRSS56P0CW18 603 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CRB2Q5IJ48 1285 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB37Q5TC79 503 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PRSS42Q7Z5A4 293 aa16■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 PPCDCQ96CD2 204 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 C12orf57Q99622 126 aa16■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 RETREG1Q9H6L5 497 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TREM1Q9NP99 234 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 GULP1Q9UBP9 304 aa16■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TMEM17Q86X19 198 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 FBXL6Q8N531 539 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.99■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 KRBOX1C9JBD0 128 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ENTPD6O75354 484 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 RAB36O95755 333 aa15.99■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 CD8B2A6NJW9 211 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CD8BP10966 210 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CTRB1P17538 263 aa15.99■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CTRB2Q6GPI1 263 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TMIEQ8NEW7 156 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PCED1BQ96HM7 432 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TOR1AO14656 332 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SLC19A2O60779 497 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TGM4P49221 684 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 AP3S2P59780 193 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PITPNAQ00169 270 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 DUSP6Q16828 381 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SAXO2Q658L1 398 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 RAB12Q6IQ22 244 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ARL9Q6T311 187 aa15.98■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 MAL2Q969L2 176 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 AP5M1Q9H0R1 490 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SH3D21A4FU49 640 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SLC28A2O43868 658 aa15.98■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 SLC43A1O75387 559 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 RAF1P04049 648 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 LGALS2P05162 132 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SDHAF4Q5VUM1 108 aa15.98■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 RBFAQ8N0V3 343 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 OR2T11Q8NH01 316 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 OR4K3Q96R72 315 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 BRINP2Q9C0B6 783 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TMEM168Q9H0V1 697 aa15.98■□□□□ 0.15
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