RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295057.3

LRRTM1-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-201ENST00000295057 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 GPR151Q8TDV0 419 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 MYDGFQ969H8 173 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 SCRN2Q96FV2 425 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 CCDC32Q9BV29 185 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 KCNH6Q9H252 994 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 IGFLR1Q9H665 355 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 E9PQ18 207 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 WNT9AO14904 365 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 FFAR2O15552 330 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 LEFTY1O75610 366 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 SLITRK5O94991 958 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 SEMG1P04279 462 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 CTSLP07711 333 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 TACR1P25103 407 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 MAPK8P45983 427 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 TGM4P49221 684 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ST3GAL4Q11206 333 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 STX19Q8N4C7 294 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 KCNJ9Q92806 393 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 TMCO6Q96DC7 493 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 TPD52L3Q96J77 140 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 TSSK3Q96PN8 268 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 EPOPA6NHQ4 379 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 HMX3A6NHT5 357 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 MTX2O75431 263 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 FGF19O95750 216 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ESR1P03372 595 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 YES1P07947 543 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 S100A3P33764 101 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 METAP1P53582 386 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 TIGARQ9NQ88 270 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 PPT2Q9UMR5 302 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ULK1O75385 1050 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 C1SP09871 688 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ITGALP20701 1170 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ACRV1P26436 265 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 HNF4AP41235 474 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 DAB2P98082 770 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF79Q15937 498 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 SLC7A6Q92536 515 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 SCAMP4Q969E2 229 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 NXPE3Q969Y0 559 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 V9GYH0 126 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 A0A1W2PQ09 198 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 H3BM21 787 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 UGT2B17O75795 530 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 TSPAN9O75954 239 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ITGA2P17301 1181 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 SPAM1P38567 509 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ETV3P41162 512 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 MED22Q15528 200 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ASB15Q8WXK1 588 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 RLIMQ9NVW2 624 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 A0A0B4J293 547 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 RFXANKO14593 260 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 RB1P06400 928 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 CTRB1P17538 263 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 KDELR2P33947 212 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 GGT2P36268 569 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 ITGA1P56199 1179 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 CSNK2BP67870 215 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 MADCAM1Q13477 382 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRTM1-201ENST00000295057 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms