RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC10-201ENST00000291574 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC10-201ENST00000291574 KCTD9Q7L273 389 aa13.13□□□□□ -0.31
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC5A11Q8WWX8 675 aa13.13□□□□□ -0.31
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TRAPPC10-201ENST00000291574 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.313e-7■■■□□ 15
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ABCC6O95255 1503 aa13.11□□□□□ -0.31
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF878C9JN71 531 aa13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC10-201ENST00000291574 ISCA2Q86U28 154 aa13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF280BQ86YH2 543 aa13.11□□□□□ -0.31
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TRAPPC10-201ENST00000291574 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC10-201ENST00000291574 CLCC1Q96S66 551 aa13.11□□□□□ -0.31
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