RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267260.4

SRRM4-201, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRM4, Length 8,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4-201ENST00000267260 CBY1Q9Y3M2 126 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 SLC15A5A6NIM6 579 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 RNF13O43567 381 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 BCHEP06276 602 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 C7P10643 843 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 MC2RQ01718 297 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 MLC1Q15049 377 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 NOXRED1Q6NXP6 359 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 TLCD1Q96CP7 247 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 TLE6Q9H808 572 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 OXSMQ9NWU1 459 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 KLHL33A6NCF5 533 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 IRF2P14316 349 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 EVI2BP34910 448 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF84P51523 738 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 TAS2R39P59534 338 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 SLC22A8Q8TCC7 542 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 TMEM234Q8WY98 164 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 FZD3Q9NPG1 666 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ADGRB1O14514 1584 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 SOX30O94993 753 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 PRKAR1BP31321 381 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 PLPP4Q5VZY2 271 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 OR5T1Q8NG75 326 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 OR13C3Q8NGS6 347 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ALPK1Q96QP1 1244 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 SLC29A3Q9BZD2 475 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 POLE4Q9NR33 117 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 RAB19A4D1S5 217 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 MSI1O43347 362 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 JUNP05412 331 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 C10orf82Q8WW14 230 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 CPXM1Q96SM3 734 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 PKP4Q99569 1192 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 G6PC3Q9BUM1 346 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 FZD10Q9ULW2 581 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ATG4BQ9Y4P1 393 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ST14Q9Y5Y6 855 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 IL32P24001 234 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ERVK-25P63136 954 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 CAPSQ13938 189 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 S100A7AQ86SG5 101 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 METTL4Q8N3J2 472 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF611Q8N823 705 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ACTL8Q9H568 366 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 GPATCH2Q9NW75 528 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 CA5BQ9Y2D0 317 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 A0A1W2PP18 115 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 RFPL2O75678 378 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 MAGEB1P43366 347 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF136P52737 540 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ACTBP60709 375 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ACTG1P63261 375 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 DSC2Q02487 901 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 RIN1Q13671 783 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 TRAM2Q15035 370 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 RABL3Q5HYI8 236 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ELP2Q6IA86 826 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 GPC2Q8N158 579 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF675Q8TD23 568 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ACBD6Q9BR61 282 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 FBXW11Q9UKB1 542 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 DHDHQ9UQ10 334 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 PEX12O00623 359 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 DFNA5O60443 496 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 LRCH4O75427 683 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 GHRHRQ02643 423 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ITPKCQ96DU7 683 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 ABCB8Q9NUT2 735 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 RLIMQ9NVW2 624 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 WDR45Q9Y484 360 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 OR6C65A6NJZ3 312 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 UCHL1P09936 223 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRM4-201ENST00000267260 OXTRP30559 389 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms