RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 WDR92Q96MX6 357 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 EBF4Q9BQW3 602 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 OR51I1Q9H343 314 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 LDAHQ9H6V9 325 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RNF6Q9Y252 685 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GJE1A6NN92 205 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 DUX1O43812 170 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MMP20O60882 483 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RASAL1O95294 804 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 AHSGP02765 367 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 OR12D2P58182 307 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 UFM1P61960 85 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CD47Q08722 323 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 OR8H3Q8N146 312 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 OR56A3Q8NH54 315 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SMOQ99835 787 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RAB9BQ9NP90 201 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ISPDA4D126 451 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 INMTO95050 263 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SCAPQ12770 1279 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 UPP1Q16831 310 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TCEAL3Q969E4 200 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CPED1A4D0V7 1026 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 AGRPO00253 132 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CD1DP15813 335 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PLP2Q04941 152 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 NPY5RQ15761 445 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KANK2Q63ZY3 851 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 STOML3Q8TAV4 291 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR51F1A6NGY5 319 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TTC34A8MYJ7 566 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TULP2O00295 520 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FLRT2O43155 660 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FHP07954 510 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 JUPP14923 745 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PHC1P78364 1004 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RNF130Q86XS8 419 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 IGSF21Q96ID5 467 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MMP27Q9H306 513 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms