RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.66□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.66□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 MAP3K3Q99759 626 aa7.66□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.66□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 MCM8Q9UJA3 840 aa7.66□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.66□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 PLXNB2O15031 1838 aa7.66□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 FLRT2O43155 660 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 SCRG1O75711 98 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 KCNK5O95279 499 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 C6orf47O95873 294 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 IL3P08700 152 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 PGCP20142 388 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 ADRA1AP35348 466 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 CCR2P41597 374 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 EFR3AQ14156 821 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 INAQ16352 499 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 MAPK14Q16539 360 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 TSC22D3Q99576 134 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 CD248Q9HCU0 757 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 TREX1Q9NSU2 369 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 CKLFQ9UBR5 152 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PPC4 97 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 TLCD2A6NGC4 264 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 TRIM24O15164 1050 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 PGRP06401 933 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 IL9P15248 144 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 AOAHP28039 575 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 CTSCP53634 463 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 FOXK1P85037 733 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 SHC2P98077 582 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 RAPSNQ13702 412 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 SNAPC1Q16533 368 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 NUP43Q8NFH3 380 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 OR2L5Q8NG80 312 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 OR8K5Q8NH50 307 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 HUS1BQ8NHY5 278 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 OLFM1Q99784 485 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 CHST10O43529 356 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 CPNE6O95741 557 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 IL33O95760 270 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 BCHEP06276 602 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 SELENOVP59797 346 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 ST3GAL3Q11203 375 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 SEMA3BQ13214 749 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 BTBD16Q32M84 506 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 IQCHQ86VS3 1027 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 ESX1Q8N693 406 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 CGREF1Q99674 301 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.65□□□□□ -1.18
NANOG-201ENST00000229307 METTL12A8MUP2 240 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 PRRT4C9JH25 899 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 FAM227AF5H4B4 570 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 CYB5AP00167 134 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 G6PDP11413 515 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 IL1RNP18510 177 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 GABRA3P34903 492 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 AHRP35869 848 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 DPTQ07507 201 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 RCAN2Q14206 197 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 PCLAFQ15004 111 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 TAZQ16635 292 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.65□□□□□ -1.19
NANOG-201ENST00000229307 ATCAYQ86WG3 371 aa7.65□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms