RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem269Q9D4Y8 254 aa6.35□□□□□ -1.39
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa6.35□□□□□ -1.39
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcna7Q17ST2 489 aa6.35□□□□□ -1.39
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1307Q7TQX1 312 aa6.35□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Enkd1Q7TSV9 346 aa6.35□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MylipQ8BM54 445 aa6.35□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CptpQ8BS40 216 aa6.35□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smad3Q8BUN5 425 aa6.35□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chpt1Q8C025 398 aa6.35□□□□□ -1.39
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2j9Q924D1 502 aa6.35□□□□□ -1.39
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa6.34□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r4K7N784 913 aa6.34□□□□□ -1.39
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Man2b2O54782 1018 aa6.34□□□□□ -1.39
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyr61P18406 379 aa6.34□□□□□ -1.39
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