RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLN3-241ENST00000635861 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
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CLN3-241ENST00000635861 DEFB126Q9BYW3 111 aa17.24■□□□□ 0.35
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CLN3-241ENST00000635861 SAT1P21673 171 aa17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 SLC12A2P55011 1212 aa17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 RAB38P57729 211 aa17.21■□□□□ 0.34
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CLN3-241ENST00000635861 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 ZNF227Q86WZ6 799 aa17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 ZNF595Q8IYB9 648 aa17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 BBOF1Q8ND07 529 aa17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 VKORC1Q9BQB6 163 aa17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 MCMBPQ9BTE3 642 aa17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
CLN3-241ENST00000635861 RNF14Q9UBS8 474 aa17.21■□□□□ 0.34
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