RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	DPPA4	Q7L190	304 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ADCK1	Q86TW2	530 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	FCRL1	Q96LA6	429 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	DOHH	Q9BU89	302 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PIPSL	A2A3N6	862 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SH3BP5	O60239	455 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	GUCY1B2	O75343	617 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SLC6A11	P48066	632 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	MAPK11	Q15759	364 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CYP2A13	Q16696	494 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	MYO9B	Q13459	2157 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	NOTCH4	Q99466	2003 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PRRT4	C9JH25	899 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	POU1F1	P28069	291 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PRMT2	P55345	433 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SCARB2	Q14108	478 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	VEZF1	Q14119	521 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	KEAP1	Q14145	624 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SZRD1	Q7Z422	152 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	FAM124A	Q86V42	546 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	DUSP21	Q9H596	190 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	REEP4	Q9H6H4	257 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341		A0A0G2JN53	185 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	QSOX1	O00391	747 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CD36	P16671	472 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TAP2	Q03519	686 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SPERT	Q8NA61	448 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	BRF2	Q9HAW0	419 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	RAD18	Q9NS91	495 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	MAFF	Q9ULX9	164 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TIMP1	P01033	207 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	STATH	P02808	62 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SEMG1	P04279	462 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	IL3	P08700	152 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	12.35	□□□□□ -0.43	1e-6	■■■□□ 17.1
SMTN-222	ENST00000612341	MPEG1	Q2M385	716 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	RGS21	Q2M5E4	152 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TAMM41	Q96BW9	452 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	COPS4	Q9BT78	406 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	RNF6	Q9Y252	685 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	FAM227A	F5H4B4	570 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	CYP17A1	P05093	508 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	HSMCR30	P0CW71	290 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	C6	P13671	934 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	SELENOW	P63302	87 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	KCNJ8	Q15842	424 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	DTX3	Q8N9I9	347 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	APH1B	Q8WW43	257 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	NUS1	Q96E22	293 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SMTN-222	ENST00000612341	DTD2	Q96FN9	168 aa		12.35	□□□□□ -0.43

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