RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C16orf87Q6PH81 154 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ENTHD1Q8IYW4 607 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDNFQ8TB73 568 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GIPC3Q8TF64 312 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APH1BQ8WW43 257 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SELENONQ9NZV5 590 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHCGQ9UBD6 479 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAC3Q9UHF0 121 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LATO43561 262 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCKP06239 509 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELP6Q0PNE2 266 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GANABQ14697 944 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MOGQ16653 247 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADPRMQ3LIE5 342 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM71E1Q6IPT2 247 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPA6Q8N4T0 437 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2L2Q8NH16 312 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNASE1L2Q92874 299 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF566Q969W8 418 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52A5Q9H2C5 316 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DYRK4Q9NR20 520 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCN3BQ9NY72 215 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa11.29□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PRB8 838 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR37L1O60883 481 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCCBP05166 539 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EPHX1P07099 455 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 P2RY2P41231 377 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL12RB1P42701 662 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALDH9A1P49189 494 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OCA2Q04671 838 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FPGSQ05932 587 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNTN1Q12860 1018 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLD3Q8IV08 490 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METTL4Q8N3J2 472 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR9Q2Q8NGE9 314 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR34Q96EX3 536 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 F2RL3Q96RI0 385 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITM2CQ9NQX7 267 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAS2R9Q9NYW1 312 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB23Q9ULC3 237 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC6A14Q9UN76 642 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PADI2Q9Y2J8 665 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A0G2JN53 185 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLON5A6NGN9 336 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRAMEF10O60809 474 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STATHP02808 62 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 JUNDP17535 347 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OPRL1P41146 370 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC19A1P41440 591 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDT6P53370 316 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK6Q00534 326 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPIBQ01892 262 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLCA4Q14CN2 919 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEAD4Q15561 434 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NLGN4XQ8N0W4 816 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD53Q8N9V6 530 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMIEQ8NEW7 156 aa11.28□□□□□ -0.6
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52N2Q8NGI0 321 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms