RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF285Q96NJ3 590 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 FCRL4Q96PJ5 515 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 KCNC2Q96PR1 638 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 OR2A5Q96R48 311 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 KCNA7Q96RP8 456 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 NRTNQ99748 197 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 CMKLR1Q99788 373 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 ZPBPQ9BS86 351 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 RTKNQ9BST9 563 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TBCDQ9BTW9 1192 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 ACPTQ9BZG2 426 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TUBB1Q9H4B7 451 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 RABEP2Q9H5N1 569 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 LRTM1Q9HBL6 345 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 FGF21Q9NSA1 209 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM45AQ9NWC5 275 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 ASIC5Q9NY37 505 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 RARRES3Q9UL19 164 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 KLHL20Q9Y2M5 609 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SPTBP11277 2137 aa5.2□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 LAMA1P25391 3075 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 BLACEA4D250 179 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 B4E171 279 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF195O14628 629 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 UBDO15205 165 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SEC22BO75396 215 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 OR2B3O76000 313 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SCELO95171 688 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 MT-CO3P00414 261 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TGFB1P01137 390 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SERPIND1P05546 499 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 PRR35P0CG20 571 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TSPAN7P41732 249 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SSR2P43308 183 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 GABRA4P48169 554 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SEPHS1P49903 392 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 NEK2P51955 445 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 RPL38P63173 70 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 HMGCS1Q01581 520 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 EMX2Q04743 252 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TUBB3Q13509 450 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM53BQ14153 422 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SQLEQ14534 574 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 RPS6KA2Q15349 733 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 AP5B1Q2VPB7 878 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 GALNTL6Q49A17 601 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SGO1Q5FBB7 561 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 CGB2Q6NT52 195 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 SCIMPQ6UWF3 145 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 Q6ZSR9 355 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 IKBIPQ70UQ0 350 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 MAVSQ7Z434 540 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 COMMD6Q7Z4G1 85 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.19□□□□□ -1.58
EFTUD2-213ENST00000589475 VN1R4Q7Z5H5 301 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms