RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	DERL2	Q9GZP9	239 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	EHD1	Q9H4M9	534 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	NT5DC2	Q9H857	520 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	WWOX	Q9NZC7	414 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	PSAT1	Q9Y617	370 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743		E7ESA3	106 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	PRRG2	O14669	202 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	CLEC3A	O75596	197 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	STMN1	P16949	149 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	MAOA	P21397	527 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	HTR1E	P28566	365 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	PTGER4	P35408	488 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	PGGT1B	P53609	377 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	ATP6V0D1	P61421	351 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	LAPTM5	Q13571	262 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	CA13	Q8N1Q1	262 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	SNX31	Q8N9S9	440 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	FRMD6	Q96NE9	622 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	CPNE1	Q99829	537 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	KLHL31	Q9H511	634 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	CD274	Q9NZQ7	290 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	SNX24	Q9Y343	169 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	SPACA6	W5XKT8	324 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-208	ENST00000579743	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	FAM187A	A6NFU0	413 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743		A8MUA0	341 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	NME2P1	O60361	137 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	STK16	O75716	305 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	NEURL1	O76050	574 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	MYO1D	O94832	1006 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	B3GALT4	O96024	378 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	GSTA2	P09210	222 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC166	P0CW27	439 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	NME2	P22392	152 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TNFRSF8	P28908	595 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	RAB38	P57729	211 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TGFBI	Q15582	683 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	C3AR1	Q16581	482 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	XKR6	Q5GH73	641 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	OR2L5	Q8NG80	312 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	UBE2E3	Q969T4	207 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	KIAA1191	Q96A73	305 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	VMP1	Q96GC9	406 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SMIM10	Q96HG1	83 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SERINC2	Q96SA4	455 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	WHRN	Q9P202	907 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	LRIT2	A6NDA9	550 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ZFAND5	O76080	213 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	IFNA16	P05015	189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	GP5	P40197	560 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	GDF5	P43026	501 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SLC6A12	P48065	614 aa		12.82	□□□□□ -0.36

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