RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541456.1

PRR4-209, Transcript of proline rich 4, human

TSL 3

Gene PRR4, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-209	ENST00000541456	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456		A0A1W2PP11	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	TULP2	O00295	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CHUK	O15111	745 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	ARPC2	O15144	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF208	O43345	1280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	EXTL3	O43909	919 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	ZIC3	O60481	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	SERPINI2	O75830	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	RFC2	P35250	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	PIGA	P37287	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	PEX5	P50542	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	VAMP7	P51809	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	GEM	P55040	296 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CD81	P60033	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	GABPA	Q06546	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	MESD	Q14696	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	MIDN	Q504T8	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CENPU	Q71F23	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	REPS1	Q96D71	796 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CUX2	O14529	1486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CLDN5	O00501	218 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	MDM4	O15151	490 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	HSPA12A	O43301	675 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	NDUFA7	O95182	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	ANP32D	O95626	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CPNE6	O95741	557 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	PAH	P00439	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	MT-ND1	P03886	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CAPN1	P07384	714 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CA3	P07451	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CHRNG	P07510	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	PTPRC	P08575	1304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	NUDT17	P0C025	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CETP	P11597	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	GNLY	P22749	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	SFTPD	P35247	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	TRIM23	P36406	574 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	MNDA	P41218	407 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	RGS4	P49798	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	RASSF2	P50749	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	CLCN4	P51793	760 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PRR4-209	ENST00000541456	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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