RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 F8W036 122 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TOR1AO14656 332 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HCRTO43612 131 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 GMFGO60234 142 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PHF2O75151 1096 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TULP3O75386 442 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CCNB2O95067 398 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 GASTP01350 101 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 UMPSP11172 480 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ITGALP20701 1170 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 MGAT1P26572 445 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SERPINB1P30740 379 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 NTSR1P30989 418 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 MAGEA1P43355 309 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PIK3CGP48736 1102 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CDH4P55283 916 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 MYL7Q01449 175 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 LIN52Q52LA3 116 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CT83Q5H943 113 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 METRNLQ641Q3 311 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 KLHL35Q6PF15 583 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 NAT14Q8WUY8 206 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 NEU1Q99519 415 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 REEP2Q9BRK0 252 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 NDST4Q9H3R1 872 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 IL21RQ9HBE5 538 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 KRT84Q9NSB2 600 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 COL12A1Q99715 3063 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 A0A1B0GTW7 788 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FAM149AA5PLN7 773 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TISP43B9A030 160 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 E9PAM4 449 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FLRT2O43155 660 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 AKR7A2O43488 359 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HUS1O60921 280 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 NDUFS2O75306 463 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CER1O95813 267 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PLA2G4BP0C869 781 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CPN2P22792 545 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ITPKBP27987 946 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 AKT1P31749 480 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 WASP42768 502 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PPP3CCP48454 512 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PITPNBP48739 271 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 HCAR3P49019 387 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TUBP50607 506 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ARL4CP56559 192 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 GNGT1P63211 74 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 GTF2BQ00403 316 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 BNC1Q01954 994 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 GAD2Q05329 585 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 RPA4Q13156 261 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CYP2A13Q16696 494 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 MST1LQ2TV78 715 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 VSTM1Q6UX27 236 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FAM131BQ86XD5 332 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SFR1Q86XK3 245 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ADGRF2Q8IZF7 708 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 KCTD6Q8NC69 237 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms