RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ZBTB18Q99592 522 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 THTPAQ9BU02 230 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 STARD5Q9NSY2 213 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A088AWK7 358 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGAP10A1A4S6 786 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 TM4SF5O14894 197 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ANGPT2O15123 496 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ERI3O43414 337 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PGRP06401 933 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PRPS1L1P21108 318 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ACP1P24666 158 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 C21orf58P58505 322 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PLIN5Q00G26 463 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PWP1Q13610 501 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PGS1Q32NB8 556 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM71E1Q6IPT2 247 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 OR2L5Q8NG80 312 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 UCN3Q969E3 161 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 TESCQ96BS2 214 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 TM4SF18Q96CE8 201 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 THAP11Q96EK4 314 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR41Q9HAD4 459 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A0A6YYD5 115 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 C9P02748 559 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 GP1BAP07359 652 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 SMIM10L1P0DMW3 83 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PGM1P36871 562 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 GABRA4P48169 554 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 WNT3P56703 355 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 GLRX5Q86SX6 157 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 DEFB124Q8NES8 71 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 OR8K5Q8NH50 307 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 SMIM10Q96HG1 83 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 CFAP73A6NFT4 308 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 FXYD1O00168 92 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 CFLARO15519 480 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 IL6P05231 212 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 LAMP1P11279 417 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 CEACAM1P13688 526 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 C2orf80Q0P641 193 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM9CQ8IZT9 166 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 IFI44Q8TCB0 444 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 NUDT22Q9BRQ3 303 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 MYNNQ9NPC7 610 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 TLCD2A6NGC4 264 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PRMT3O60678 531 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 SCN2BO60939 215 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAJB6O75190 326 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 IL3P08700 152 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ASMTP46597 345 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 GPLD1P80108 840 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ILKQ13418 452 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF385BQ569K4 471 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 COQ5Q5HYK3 327 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 OR4F3Q6IEY1 312 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 GTF2H4Q92759 462 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 TCTN2Q96GX1 697 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 OR52E6Q96RD3 313 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 CDRT15Q96T59 188 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 CENPKQ9BS16 269 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAM29Q9UKF5 820 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 CEP250Q9BV73 2442 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 S100A3P33764 101 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 MAPK12P53778 367 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PSME3P61289 254 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 CCL7P80098 99 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PAGE2Q7Z2X7 111 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-209ENST00000532457 SHISA5Q8N114 240 aa20.85■□□□□ 0.93
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