RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505870.5

GMDS-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 8,217 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ZNF616Q08AN1 781 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 RFWD3Q6PCD5 774 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 LCTLQ6UWM7 567 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NSMAFQ92636 917 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 HSFY1Q96LI6 401 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 GPR34Q9UPC5 381 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 DHDHQ9UQ10 334 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 HSPB11Q9Y547 144 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ACTL7AQ9Y615 435 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ARVCFO00192 962 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 GMDSO60547 372 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PEPDP12955 493 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CLCNKAP51800 687 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CDNFQ49AH0 187 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 C7orf34Q96L11 122 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 DUSP16Q9BY84 665 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NANOGQ9H9S0 305 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 DNM1LO00429 736 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TGFB1P01137 390 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ADH6P28332 368 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NSG1P42857 185 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ALDH3B1P43353 468 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 QPCTQ16769 361 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MOAP1Q96BY2 351 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MUC13Q9H3R2 512 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ACTL8Q9H568 366 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 HOXC8P31273 242 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 FGL1Q08830 312 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PIGGQ5H8A4 983 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 FUT10Q6P4F1 479 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ZNF559Q9BR84 538 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 GJD2Q9UKL4 321 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 LRRN3E7EW58 273 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 INSIG1O15503 277 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PCDH7O60245 1069 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ZNF28P17035 718 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 DDCP20711 480 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NRIP1P48552 1158 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 THBS3P49746 956 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PPP2CAP67775 309 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 KLF10Q13118 480 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NUDT13Q86X67 352 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 OR2T3Q8NH03 318 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 FUZQ9BT04 418 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SNX15Q9NRS6 342 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.5□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SCO2O43819 266 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 SNAPC5O75971 98 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 COL6A2P12110 1019 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CUZD1Q86UP6 607 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 LPGAT1Q92604 370 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TGM7Q96PF1 710 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 FKRPQ9H9S5 495 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CNTN3Q9P232 1028 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CDH22Q9UJ99 828 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 REREQ9P2R6 1566 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 ITSN1Q15811 1721 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 GTF2F2P13984 249 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 TIMP2P16035 220 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 LCN1P31025 176 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-202ENST00000505870 CD79BP40259 229 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms