RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496332.5

THBS3-208, Transcript of thrombospondin 3, human

TSL 3

Gene THBS3, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THBS3-208	ENST00000496332	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	RNF32	Q9H0A6	362 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MMP25	Q9NPA2	562 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SNX15	Q9NRS6	342 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PTPN13	Q12923	2485 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	OR5H15	A6NDH6	313 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TUBB4A	P04350	444 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CD22	P20273	847 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MAOA	P21397	527 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CASP2	P42575	452 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PLA2G16	P53816	162 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SLC26A5	P58743	744 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CHIT1	Q13231	466 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	LAPTM5	Q13571	262 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	RUNX2	Q13950	521 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TBCC	Q15814	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	FAR1	Q8WVX9	515 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	OPTC	Q9UBM4	332 aa		11.11	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332		A0A088AWK7	358 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332		A0A096LPK6	155 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SYCE1L	A8MT33	242 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332		K7EPI3	171 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	E2F3	O00716	465 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	B3GALT2	O43825	422 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PRAMEF2	O60811	474 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ACSL3	O95573	720 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MTHFD2	P13995	350 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	EDN3	P14138	238 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TYK2	P29597	1187 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ECHS1	P30084	290 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SERPINB8	P50452	374 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ACAP2	Q15057	778 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MEP1A	Q16819	746 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	BEST3	Q8N1M1	668 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SLC5A8	Q8N695	610 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	BCORP1	Q8N888	145 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	F2RL3	Q96RI0	385 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TAAR6	Q96RI8	345 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	FMO2	Q99518	471 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	NPAS2	Q99743	824 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	FUT8	Q9BYC5	575 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	VPS11	Q9H270	941 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.1	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CCDC189	A1A4V9	331 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332		A8MUA0	341 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MAN1A2	O60476	641 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	KLHL2	O95198	593 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	RNF224	P0DH78	156 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MYBL2	P10244	700 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PCNA	P12004	261 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	GP1BB	P13224	206 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	GFAP	P14136	432 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	EPB42	P16452	691 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CERS1	P27544	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MSH2	P43246	934 aa		11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MTTP	P55157	894 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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