RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	OLR1	P78380	273 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF33B	Q06732	778 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	STX4	Q12846	297 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF2H2	Q13888	395 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	SETDB1	Q15047	1291 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	IGFBP7	Q16270	282 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	FHL5	Q5TD97	284 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZS92	163 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PDSS2	Q86YH6	399 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	ESAM	Q96AP7	390 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	MIB2	Q96AX9	1013 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	MOCOS	Q96EN8	888 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR34	Q96EX3	536 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PPCS	Q9HAB8	311 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	AHSP	Q9NZD4	102 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	LUZP4	Q9P127	313 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	COPG2	Q9UBF2	871 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	FCHO1	O14526	889 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	JRK	O75564	520 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN9	O95484	217 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	C1QA	P02745	245 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	IFNA16	P05015	189 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	COX7A2	P14406	83 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2R1B	P30154	601 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PIK3CB	P42338	1070 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	CASP2	P42575	452 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	SSR2	P43308	183 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	HSD17B7	P56937	341 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB38	P57729	211 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	IRF9	Q00978	393 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	IFT88	Q13099	833 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	BIK	Q13323	160 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PCOLCE	Q15113	449 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	10.67	□□□□□ -0.7	3e-12	■■■■□ 24.4
TTLL3-231	ENST00000496246	INA	Q16352	499 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	COLEC12	Q5KU26	742 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	RGMA	Q96B86	450 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	C5orf34	Q96MH7	638 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF32	Q9H0A6	362 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	IPPK	Q9H8X2	491 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR41	Q9HAD4	459 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	MMP25	Q9NPA2	562 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PHF11	Q9UIL8	331 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	PLAA	Q9Y263	795 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC151	A5D8V7	595 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	STX16	O14662	325 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	RIPK2	O43353	540 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	CD46	P15529	392 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	TNNI3	P19429	210 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	CD97	P48960	835 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	ARFIP1	P53367	373 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	RHAG	Q02094	409 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	DLG1	Q12959	904 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	SERTAD2	Q14140	314 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-231	ENST00000496246	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		10.66	□□□□□ -0.7

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