RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PPW3 197 aa19.95■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 TIMP1P01033 207 aa19.95■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ZNF823P16415 610 aa19.95■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ZNF534Q76KX8 674 aa19.95■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ACVR1CQ8NER5 493 aa19.95■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 TAMM41Q96BW9 452 aa19.95■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 HRASLS2Q9NWW9 162 aa19.95■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ADAMTS4O75173 837 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 RENP00797 406 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 KBTBD6Q86V97 674 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CNTN4Q8IWV2 1026 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ANKFN1Q8N957 763 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 LMX1AQ8TE12 382 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 SLC25A36Q96CQ1 311 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CLSTN3Q9BQT9 956 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 MND1Q9BWT6 205 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 TMEM9Q9P0T7 183 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 OR12D1P0DN82 309 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 RHBDF1Q96CC6 855 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 KLHL18O94889 574 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 RUNX3Q13761 415 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 NDUFA5Q16718 116 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 HSDL2Q6YN16 418 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 OR4K14Q8NGD5 310 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 NCSTNQ92542 709 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 FAM129BQ96TA1 746 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CPED1A4D0V7 1026 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ZNF860A6NHJ4 632 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 MS4A2Q01362 244 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CARM1Q86X55 608 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 NRROSQ86YC3 692 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 TCEANCQ8N8B7 351 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 KLHDC7BQ96G42 594 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 WDR92Q96MX6 357 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 XPNPEP2O43895 674 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 HPRP00739 348 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 C7P10643 843 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 TUBA3CQ13748 450 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CST9Q5W186 159 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CDH24Q86UP0 819 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ADAM12O43184 909 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CXCR1P25024 350 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 TGFBR2P37173 567 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 SUOXP51687 545 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CDH11P55287 796 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 NFE2L1Q14494 772 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 GPR26Q8NDV2 337 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CD180Q99467 661 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 TCF7L1Q9HCS4 588 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 DIABLOQ9NR28 239 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 RTCAO00442 366 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 BMP8BP34820 402 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 RGRP47804 291 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ADAM17P78536 824 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 MARCH9Q86YJ5 346 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CNIH3Q8TBE1 160 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 SLC39A13Q96H72 371 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 RNF38Q9H0F5 515 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CAPN14A8MX76 684 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 SLC16A8O95907 504 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 KCNA5P22460 613 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 NRG3P56975 720 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 DEFB103AP81534 67 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 TYSND1Q2T9J0 566 aa19.93■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ANXA2P2A6NMY6 339 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 SOCS2O14508 198 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 SERPINA3P01011 423 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ATF6P18850 670 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 GGT1P19440 569 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 TRAM2Q15035 370 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 PON2Q15165 354 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 C6orf141Q5SZD1 244 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 DEFB119Q8N690 84 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 MOAP1Q96BY2 351 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 MCHR1Q99705 422 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 PCDHGA12O60330 932 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 RPS17P08708 135 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 ADRB3P13945 408 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 GNALP38405 381 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CST6Q15828 149 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 CLECL1Q8IZS7 167 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-201ENST00000345716 BBS10Q8TAM1 723 aa19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms