RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 DOCK8Q8NF50 2099 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 M0QX08 132 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 DPM1O60762 260 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 TNFRSF21O75509 655 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 INMTO95050 263 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 PCCBP05166 539 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 ITIH1P19827 911 aa16.87■□□□□ 0.29
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SPNS1-202ENST00000323081 KELP23276 732 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
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SPNS1-202ENST00000323081 GCNT6Q5T4J0 391 aa16.87■□□□□ 0.29
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SPNS1-202ENST00000323081 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16.87■□□□□ 0.29
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SPNS1-202ENST00000323081 OR52N2Q8NGI0 321 aa16.87■□□□□ 0.29
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SPNS1-202ENST00000323081 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
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SPNS1-202ENST00000323081 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.87■□□□□ 0.29
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SPNS1-202ENST00000323081 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 DOCK9Q9BZ29 2069 aa16.86■□□□□ 0.29
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SPNS1-202ENST00000323081 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 PRSS53Q2L4Q9 553 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 PNCKQ6P2M8 343 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 LCTLQ6UWM7 567 aa16.86■□□□□ 0.29
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SPNS1-202ENST00000323081 OXR1Q8N573 874 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 SLC15A4Q8N697 577 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 RAB7BQ96AH8 199 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 FKBP10Q96AY3 582 aa16.85■□□□□ 0.29
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SPNS1-202ENST00000323081 MIEF1Q9NQG6 463 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS1-202ENST00000323081 SCN3BQ9NY72 215 aa16.85■□□□□ 0.29
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