RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cox8aQ64445 69 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rexo4Q6PAQ4 432 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 ExogQ8C163 368 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Paqr5Q9DCU0 330 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tubd1Q9R1K7 455 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 B4galt6Q9WVK5 382 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr316A0A0N4SVP2 306 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Klhl4B1AZR0 717 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr620E9PZ66 313 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp715G3X9T1 886 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm3033M0QWI0 180 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm3532M0QWL4 194 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clec2lP0C7M9 211 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 AboP38649 332 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cct3P80318 545 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 GiprQ0P543 460 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lpar5Q149R9 372 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm732Q3V0P9 516 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr318Q5NCD7 306 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zzz3Q6KAQ7 910 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem214Q8BM55 687 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc51aQ8R000 340 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ms4a10Q99N03 267 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr930Q9EQ99 308 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm8050L7N2E3 205 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 UgdhO70475 493 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 ApodP51910 189 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hsd17b3P70385 305 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 AccslQ3UX83 580 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 RgnQ64374 299 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zar1Q80SU3 361 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr683Q8VGV1 319 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 DdoQ922Z0 341 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Prkar1aQ9DBC7 381 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tgfbr3lD3YZZ2 297 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm10800D3Z496 220 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 FpgtG5E8F4 590 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hoxd12P23812 268 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Btbd3P58545 530 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 H2-Q6P79568 326 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 CtscP97821 462 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trappc13Q3TIR1 417 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zpbp2Q6X786 326 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm5346Q7M766 736 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clrn3Q8BHH8 226 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf628Q8CJ78 1038 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 B4galt7Q8R087 327 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lmcd1Q8VEE1 365 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 EurlQ9D7G4 290 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Usp12Q9D9M2 370 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cpne8Q9DC53 577 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dusp13Q9QYJ7 198 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccr7P47774 378 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc1a5P51912 553 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 P4ha2Q60716 537 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Wdr48Q8BH57 676 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tspan33Q8R3S2 283 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zdhhc21Q9D270 265 aa5.65□□□□□ -1.5
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adh6aE9Q5Z6 375 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Obox5G3X9P6 291 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 MaffO54791 156 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hbq1bQ3U0A6 142 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 OclnQ61146 521 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Six3Q62233 333 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1322Q7TQW3 310 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr744Q7TRM0 323 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plekhm3Q8BM47 761 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rft1Q8C3B8 541 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plekhh3Q8VCE9 796 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cdc42ep1Q91W92 409 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Commd4Q9CQ02 199 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pbdc1Q9D0B6 198 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ly75Q60767 1723 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adam3F8VQ03 822 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm5145F8VQ88 278 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pgam2O70250 253 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm1123Q1RME4 390 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clec4a4Q5YIR8 236 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp446Q8C9M8 523 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tex13bQ99MW5 186 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Serpini2Q9JK88 405 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lcn11A2BHR2 178 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm3752A6NAT4 150 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp395E9Q5N9 508 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp605E9QAH2 694 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rhox2gL7MUB9 191 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ighg1P01869 393 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Xrra1Q3U3V8 786 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cntn4Q69Z26 1026 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cadm2Q8BLQ9 435 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 EndovQ8C9A2 338 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trmt5Q9D0C4 501 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 NmuQ9QXK8 174 aa5.65□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rgs17Q9QZB0 210 aa5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.3 ms