Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Gm1123Q1RME4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Gm1123Q1RME4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gm1123Q1RME4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Gm1123Q1RME4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gm1123Q1RME4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Gm1123Q1RME4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Gm1123Q1RME4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gm1123Q1RME4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gm1123Q1RME4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gm1123Q1RME4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gm1123Q1RME4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gm1123Q1RME4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Gm1123Q1RME4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gm1123Q1RME4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gm1123Q1RME4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gm1123Q1RME4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Gm1123Q1RME4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm1123Q1RME4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm1123Q1RME4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gm1123Q1RME4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm1123Q1RME4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gm1123Q1RME4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm1123Q1RME4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm1123Q1RME4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm1123Q1RME4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm1123Q1RME4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm1123Q1RME4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm1123Q1RME4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm1123Q1RME4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm1123Q1RME4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm1123Q1RME4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm1123Q1RME4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm1123Q1RME4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm1123Q1RME4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm1123Q1RME4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm1123Q1RME4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm1123Q1RME4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm1123Q1RME4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm1123Q1RME4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm1123Q1RME4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm1123Q1RME4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm1123Q1RME4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm1123Q1RME4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm1123Q1RME4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm1123Q1RME4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm1123Q1RME4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm1123Q1RME4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm1123Q1RME4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm1123Q1RME4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm1123Q1RME4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm1123Q1RME4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm1123Q1RME4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm1123Q1RME4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm1123Q1RME4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm1123Q1RME4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm1123Q1RME4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm1123Q1RME4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm1123Q1RME4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm1123Q1RME4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gm1123Q1RME4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm1123Q1RME4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm1123Q1RME4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm1123Q1RME4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm1123Q1RME4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm1123Q1RME4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm1123Q1RME4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm1123Q1RME4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm1123Q1RME4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm1123Q1RME4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm1123Q1RME4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm1123Q1RME4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm1123Q1RME4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm1123Q1RME4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm1123Q1RME4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm1123Q1RME4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm1123Q1RME4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm1123Q1RME4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm1123Q1RME4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm1123Q1RME4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm1123Q1RME4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm1123Q1RME4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm1123Q1RME4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm1123Q1RME4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm1123Q1RME4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm1123Q1RME4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm1123Q1RME4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gm1123Q1RME4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm1123Q1RME4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm1123Q1RME4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm1123Q1RME4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm1123Q1RME4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm1123Q1RME4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm1123Q1RME4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm1123Q1RME4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm1123Q1RME4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm1123Q1RME4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm1123Q1RME4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm1123Q1RME4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm1123Q1RME4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms