RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 ACOT9Q9Y305 439 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PIPSLA2A3N6 862 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 STK17BO94768 372 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TFAP2AP05549 437 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGP20916 626 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CLCN7P51798 805 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GRB7Q14451 532 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DCAF12Q5T6F0 453 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM164Q5U3C3 297 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PAQR3Q6TCH7 311 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GK5Q6ZS86 529 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 METTL25Q8N6Q8 603 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PEX13Q92968 403 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 OLFM1Q99784 485 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 EFCAB1Q9HAE3 211 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF33A8MVX0 844 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TARM1B6A8C7 271 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 AP3B1O00203 1094 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 C9P02748 559 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 UGT2B7P16662 529 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PSMD7P51665 324 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS18P62269 152 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CDKL1Q00532 357 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NFKB2Q00653 900 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NADK2Q4G0N4 442 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 COLEC12Q5KU26 742 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFP1Q6P2D0 407 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DLG3Q92796 817 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ADA2Q9NZK5 511 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 VTI1BQ9UEU0 232 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CROCCQ5TZA2 2017 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 STMN1P16949 149 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 F8A1P23610 371 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB10P61026 200 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MYBPC1Q00872 1141 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PTCHD3Q3KNS1 767 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM219BQ5XKK7 198 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PLD3Q8IV08 490 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CD200R1Q8TD46 325 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TAAR9Q96RI9 348 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB26Q9ULW5 256 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM150CB9EJG8 249 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SLCO2B1O94956 709 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ESR1P03372 595 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NELFEP18615 380 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ERVPABLB-1P60509 514 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf189Q5VU69 101 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX31Q8N9S9 440 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR78Q96P69 363 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 IKZF3Q9UKT9 509 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTS20P59510 1910 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SLCO1B7G3V0H7 640 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SDHDO14521 159 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A2O15244 555 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf105O95561 183 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 OGNP20774 298 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CD9P21926 228 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TAS2R39P59534 338 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RPA4Q13156 261 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 HERC3Q15034 1050 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SF1Q15637 639 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NRF1Q16656 503 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 IL23RQ5VWK5 629 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LCN10Q6JVE6 187 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP6V1E2Q96A05 226 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2A14Q96R47 310 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHAC1Q9H158 963 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 POMT2Q9UKY4 750 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087WV48 116 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM8BA6NDV4 472 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TLCD2A6NGC4 264 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ACOT8O14734 319 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms