RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ST3GAL3Q11203 375 aa7.76□□□□□ -1.17
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PTPRB-209ENST00000550857 ZNF597Q96LX8 424 aa7.75□□□□□ -1.17
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PTPRB-209ENST00000550857 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
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